2011.08.08
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SEQUENCHER V5.0がついに登場! 次世代シーケンサーに対応 |
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┃ 日立ソリューションズ DNASIS NEWS 第61号 2011/8/8
□━━━━━━━━━━━━━ http://hitachisoft.jp/dnasis/?dn061i□
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このメールは、日立ソリューションズの展示会およびセミナーにお申し込み・
ご参加いただき、情報送信にご了承をいただいている方、弊社関係者が名刺を
頂戴している皆様にお送りしています。
配信停止等をご希望の際は、本文末をご覧下さい。
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夏季休業のお知らせ
【弊社バイオインフォマティックス製品】
弊社バイオインフォマティックス製品のお問い合わせ・テクニカルサポート
の受付は下記の期間休業とさせていただきます。
休業期間:2011年8月10日(水)~2011年8月16日(火)
電子メール、FAXでのお問い合わせは受け付けておりますが、
回答は2011年8月17日(水)以降となります。
【受託解析サービス】
受託解析サービスにつきましては、下記の期間、休業とさせて頂きます。
休業期間:2011年8月10日(水)~2011年8月16日(火)
お客様にはご不便をおかけしますが、何卒よろしくお願いいたします。
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☆ INDEX ☆\__________________________
1┃News担当者からひとこと
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2┃SEQUENCHER V5.0がついに登場! 次世代シーケンサーに対応
━┛
3┃コラム
━┛今話題の「クラウド」とは?(その1)
4┃DNASIS Pro V3.0が64ビットOSに対応
━┛
5┃DNASIS Taxon V3.1登場!データベースも配信中
━┛
6┃微生物研究を効率化! 微生物研究ソリューション
━┛
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□━┓ News担当者からひとこと
┃1┃
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皆様こんにちは。日立ソリューションズの八塚です。前回の配信からずいぶんご
無沙汰してしまったことをお詫びいたします。
もうすぐ夏休みという方も多いと思います。休み前の一仕事ということでお忙し
いとは思いますが、今回もどうか最後までお付き合いいただければ幸いです。
□━┓ SEQUENCHER V5.0がついに登場! 次世代シーケンサーに対応
┃2┃
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DNA配列アセンブルソフトウェアの決定版「SEQUENCHER」がV5.0にバージョンア
ップしました。
= 製品紹介 =
SEQUENCHERは、各種DNAシーケンサから出力された配列フラグメントを強力な
アルゴリズムと簡単な操作により高速にアセンブルするソフトウェアです。
= V5.0の新機能 =
■ 次世代シーケンサーデータのアセンブル
次世代シーケンサーから出力された膨大な配列データ(FastA, FastQ形式)をア
センブルすることができます。アセンブルには、次世代シーケンサー用アセンブ
ルツールとして定評のあるMaqとGSNAPを使うことができます。
■ 次世代シーケンサーデータのコンティグ表示
アセンブルした次世代シーケンサーデータを、グラフィカルに表示することがで
きます。ビューワーにはMaqViewとTabletを使うことができます。
■ 次世代シーケンサーデータのSNP解析
MaqやGSNAPを利用して、次世代シーケンサーデータからSNP解析を行うこともで
きます。
■ メチル化解析
GSNAPを使ってメチル化解析を行うことができます。亜硫酸水素ナトリウムによ
ってチミンに変換されたシトシンを検出し、変換されていないゲノム配列とアセ
ンブルすることができます。
■ NCBI Blast検索
コンティグや配列の一部を選択してNCBIのサイトに送信し、Blast検索を行うこ
とができます。
★☆ 標準価格 ☆★
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SEQUENCHER for Windows V5.0 ¥924,000(税込)
SEQUENCHER for Macintosh V5.0 ¥714,000(税込)
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★☆ V4.5以上をお持ちのお客様にはお得なアップグレード版もあります ☆★
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アップブレード版(ドングル交換有り) ¥210,000(税込)
アップブレード版(ドングル交換無し) ¥168,000(税込)
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□ SEQUENCHERの詳細はこちら □
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/SEQUENCHER/?dn061
□━┓ コラム
┃3┃ 今話題の「クラウド」とは?(その1)
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昨年あたりから「クラウド」という言葉を耳にする機会が多くなったという方は
多いのではないでしょうか?しかし、「クラウド」は様々な文脈で登場するため、
「一体どういう意味なの?」と疑問をお持ちの方も少なくないと思われます。
そこで、今回と次回のコラムでは「クラウド」について簡単に説明すると共に、
「クラウド」が今後バイオ業界に与える影響について少し考えてみたいと思いま
す。
そもそも「クラウド」とは「クラウドコンピューティング」の略称です。IT用語
辞典(http://e-words.jp/)によれば、「従来は手元のコンピュータで管理・利用
していたようなソフトウェアやデータなどを、インターネットなどのネットワー
クを通じてサービスの形で必要に応じて利用する方式。」と定義されています。
もう少し具体的な説明がWikipedia日本語版(http://ja.wikipedia.org/)にまと
められていますので、そちらを参考にすると、「クラウド」の定義としては以下
の3つのものになります。
1.インターネット経由でユーザに直接ソフトウェアを提供するもの(フリー
のWebメールやCRM(顧客管理システム)など)
2.インターネット経由でソフトウェアを実行するためのプラットフォームを
提供するもの(1のソフトウェアを開発するために開発者が利用するもの
と考えてください)
3.インターネット経由でハードウェアなどを提供するもの(インターネット
上でもう1台のパソコンやハードディスクが使えるものと考えてくださ
い)
この定義に従えば、バイオの研究者の方々にとってのクラウドとは、インターネ
ット上で様々な遺伝子解析が行えたり(例:NCBIが提供する様々な解析サービス
など)、ハードディスクを購入する代わりにインターネット上のディスクを利用
できるようなサービスのことを指していると言えます。
次回のコラムでは、この「クラウド」が今後バイオ業界にどのような影響を与え
るかについて少し考えてみたいと思います。
□━┓ DNASIS Pro V3.0が64ビットOSに対応
┃4┃
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DNASIS Pro V3.0がWindows 7 64ビット版に対応しました。
V3.0をお持ちのお客様は、以下のページから64ビット版OS対応パッチをダウン
ロードしてください。
また、DNASIS Pro ネットワーク版をお使いのお客様で、ライセンスサーバを
Windows 7 64ビット版搭載のサーバにインストールする場合にも、以下のページ
からライセンスサーバV2.2をダウンロードしてください。
ダウンロードページ:
http://hitachisoft.jp/products/lifescience/support/patch/patch1.html
DNASIS Pro好評発売中
★☆ 標準価格 ☆★
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DNASIS Pro V3.0 ¥472,500(税込)
DNASIS Pro V3.0 ネットワーク版(3ライセンス付) ¥787,500(税込)
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★☆ V2.0以上をお持ちのお客様にはお得なアップグレード版もあります ☆★
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アップブレード版 ¥105,000(税込)
アップブレード版(ネットワーク版) ¥105,000(税込)
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□ DNASIS Proの詳細はこちら □
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/DNASISPro/?dn061
□━┓ DNASIS Taxon V3.1登場!データベースも配信中
┃5┃
┗━□─────────────────────────────────
微生物同定ソフトウェアDNASIS Taxon V3.1を3月上旬より販売しています。
最新バージョンでは、16S rRNAなどのデータベース配信サービス(別途有償)を
ご利用頂けるようになります。
また、新しいライセンス体系としてサブスクリプションライセンスを設けまし
た。通常の永久ライセンスと比較し、初期費用を抑えてソフトウェアを導入す
ることができます。
サブスクリプションライセンスでは、ご契約期間中はデータベース更新Basic
サービス及びソフトウェアのアップグレードは、無償でご利用頂けます。
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┗■ 製品の詳細はこちら
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/DNASISTaxon/?dn061
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┗■データベース更新 Basicサービス 配信コンテンツ
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細菌16S rRNA 16S rRNA配列を収集
環境微生物16S rRNA ENVディビジョンから16S rRNA配列を収集
真菌・カビITS PLNディビジョンからITS配列を収集
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┗■ 標準価格(税別)
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サブスクリプション版(1年間) 1ライセンス \285,000
スタンドアローン版 1ライセンス \950,000
ネットワーク版 3同時使用ライセンス \2,565,000
データベース更新サービスBasic \150,000
データベース更新サービスBasic(ネットワークライセンス用) \375,000
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□━┓微生物研究を効率化! 微生物研究ソリューション
┃6┃
┗━□─────────────────────────────────
○菌株の16S rRNA塩基配列解析に基づく微生物簡易同定
○クローンライブラリ解析
○次世代シーケンサによる細菌群集構造解析
○Real-time PCRによる特定菌種の定量解析
受託解析サービス+バイオインフォマティクスで研究を支援します。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/jyutaku/?dn061
★微生物管理ソリューション★
煩雑化した微生物管理業務にお困りではありませんか?
微生物管理システムで業務を統合管理することで、個々の作業内容の同期を
とり、進捗を一目で確認することができます。
お客様のワークフローを標準化し、トータルの作業時間削減を実現します。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/system/microbe_admin.html?dn061
★基準株(Type Strain)データベース構築ソリューション★
基準株(Type Strain)データベース構築ソリューションでは、時間と手間のか
かる基準株データベース作成を自動化することができます。
お客様独自の抽出条件・キーワードで公共DBから基準株データを抽出し、お客
様のご要望に沿ったデータベースを構築します。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/system/strain_db.html?dn061
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下記の日立ソリューションズの製品・サービス紹介ページも是非ご覧ください。
▼DNASIS Pro
豊富な遺伝子配列解析機能を搭載し、簡単な操作で配列解析を行うことが
できます。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/DNASISPro/?dn061
▼DNASIS Taxon
微生物モニタリング、難培養微生物探索、食品微生物検査、微生物の同定に
関わるさまざまな解析をサポートします。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/DNASISTaxon/?dn061
▼SEQUENCHER
高速高精度にDNA配列アセンブルを行います。SNP探索にも効果を発揮します。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/SEQUENCHER/?dn061
▼Redasoft Visual Cloning
直感的な操作で、プラスミドマップを作成できます。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/RVC/?dn061
▼BioPackage
美しいグラフィックと優れた操作性を兼ね備えたタンパク質立体構造
シミュレーションソフトウェアです。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/dnasis/Biopackage/?dn061
▼MasterPlex ReaderFit
使いやすいと評判のマイクロプレート用定量解析ソフトウェアです。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/masterplex/readerfit/?dn061
▼微生物簡易同定サービス
大量の菌株解析からゲノム解析・微生物データベース開発まで、
微生物解析に関わるお悩みはお気軽にご相談下さい。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/jyutaku/?dn061
▼次世代シーケンサー受託解析サービス
これから研究をご計画されているお客様、すでにデータを取得しているが、
解析にお困りの方、まずはご相談ください。
http://hitachisoft.jp/dnasis/lineup/jyutaku/nextgen/?dn061
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※SEQUENCHERは米国Gene Codes社の登録商標です。
※Redasoft Visual CloningはカナダRedasoft社の商標です。
※Windows、Windows Vistaは米国及びその他の国における
米国Microsoft Corp.の登録商標または商標です。
※DNASIS、BioPackageは株式会社日立ソリューションズの登録商標です。
社名一覧
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