シーケンサーとアレイを1台のシステムで：新製品 HiScanSQ リリース
次世代シーケンサーのパイオニア、イルミナから新たなシステムの登場です。
この新しい HiScanSQ は、HiSeq 2000と同じフローセルを用いて1回のランで50Gbのスループットを可能にします。またアレイ用のモジュールと組み合わせることで SNPアレイやメチル化アレイにも対応。 シーケンサーでの発見をアレイのコンテンツに搭載してプロファイリング解析、あるいはアレイで見つけたマーカー付近をターゲット領域シーケンスで詳細解析するなど、これまでのゲノム解析ツールをこの1台に集約しました。
HiScanSQ 製品ページ（英語）
HiScanSQ ブローシャー（英語）
HiScanSQ DataSheet（英語）

◆◆◆ HiScanSQの発売を記念して、9/30までの特別キャンペーンを実施します。詳細はイルミナ株式会社営業部までお問い合わせください ◆◆◆
速報： 3/18 次世代シーケンサーセミナー終了
参加登録が予定を大幅に超えた次世代シーケンサーセミナーが3/18に開催されました。HiScanSQ のアナウンスとともに、次世代シーケンサーの最高機種であるHiSeq 2000 のテクノロジー詳細、また世界標準 Genome AnalyzerIIx をより多くの研究者の皆様にお使いいただけるようにリリースされた Genome Analyzer IIe の登場、と盛りだくさんな内容でセミナーをお届しました。今後も次世代シーケンサーの開発に注力するイルミナにぜひご期待を！
今月の論文ピックアップ：
124人メタゲノム、4000年前のエスキモー、ワイナリーから病原菌
124人メタゲノムを短鎖リードで解析
124人の腸内細菌をGenome Analyzerで解析。44bp、そして75bpペアエンドからなる合計576.7Gb の塩基情報をアセンブリし、ヒトの遺伝子セットより150倍以上の約330万のユニークなORFを作成。ヒトには1000種以上のバクテリアが存在し、うち約160種は個人間で共通していることが示唆されました。
A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing （論文PDF）
4000年前のエスキモーからヒト全ゲノムリシーケンス解析
グリーンランドの永久凍土層から得られた毛髪からゲノムをシーケンス。20xのカバレッジでゲノムの79%をカバーした結果、約30万のSNPが見つかりました。SNPを用いたPrincipal Component解析により、この男性はより北東シベリア集団に近いということがわかり、古代の人種民族移動を示唆できる解析となりました。
Ancient human genome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo（論文PDF）
南アフリカワイナリーから病原菌探索
病原菌に感染したMerlotのブドウからdsRNAを抽出。Genome Analyzerでシーケンスを行い、アセンブリ後に病原菌を探索。GLRaV-3など既知の病原菌ゲノムが検出されましたが、うちひとつは南アフリカでこれまで報告されていない種であることがわかりました。
Deep sequencing analysis of viruses infecting grapevines: Virome of a vineyard