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2010.04.30

イルミナ 受託サービスでGenome Analyzerを使ってみませんか？




女優グレン・クローズさんと元Solexa社CEO家族のゲノムを解読

イルミナのCLIAラボで行っている消費者むけゲノムシーケンスサービスでは、女優グレン・クローズさんのゲノム配列を解読しました。BringChange2Mindという非営利団体の共同創設者でもあるグレン・クローズさんは、家族のなかに躁鬱病や統合失調症の方がいたという経験もあり、研究により精神疾患の遺伝的背景を解き明かすことを期待していると話しています。

また、イルミナは元Solexa社CEOのジョン・ウェスト氏の家族4名のゲノムも解読したことを発表しました。両親と2人の子供のゲノムを解読しましたが、今回NCBIデータベースに提出したのは１人（親）のゲノムのみで、まだ未成年の子供たちは21才になった時にNCBIにデータを提出するか決めることができるようにアレンジしました。 

プレスリリース：女優グレン・クローズさんのゲノムを解読（英語）
プレスリリース：元Solexa社CEOジョン・ウェスト氏の家族のゲノムを解読（英語） 
 受託サービスでGenome Analyzerを使ってみませんか？

日本国内にて、イルミナGenome Analyzerを導入して受託解析を展開している会社が2社あります。これらはイルミナが認証したCSPro受託サービス（Certified Service Provider）を取得しています。もしシーケンスの受託をお考えの場合は、ぜひ高品質なデータを提供するCSPro受託機関までお問い合わせください。 

タカラバイオ株式会社ドラゴンジェノミクスセンター
北海道システム・サイエンス株式会社 


今月の論文ピックアップ：
4万年前の類人猿、レジオネラ肺炎、黒色腫miRNAオーム

4万年前の類人猿のミトコンドリアDNA 
南シベリアのアルタイ山脈から得られた骨粉からDNAを抽出。プライマー伸長キャプチャー法でミトコンドリアを選択してシーケンス。ペアエンド75bpのうち、11bpをオーバーラップさせて134bpのシングルリードとして解析を行っています。 

The complete mitochondrial DNA genome of an unknown hominin from southern Siberia 

レジオネラ肺炎をもたらす菌のゲノム＆トランスクリプトーム解析 
土中や池などに存在するレジオネラ菌のうちL. longbeachaeの4種を解析。真核生物のようなドメインコードをもつ基質をもっており、これらが宿主の遺伝子機能に障害を起こし肺炎の原因となのではと述べています。また植物病原性細菌に存在するタンパクや植物を分解する酵素を持ち合わせていることから、ヒトだけではなく植物との相互作用の可能性も考えられるようです。 

Analysis of the Legionella longbeachae genome and transcriptome uncovers unique strategies to cause Legionnaires' disease (論文PDF) 

黒色腫におけるmiRNAの特徴づけ 
黒色腫由来の12の異なるセルラインにおけるmiRNA解析。539の既知miRNAを観察、なかでも高い発現を示していたのはlet-7fと7aでした。また279もの新規miRNAの候補を発見。次世代シーケンサーを用いたmiRNA解析の可能性を大きく示しています。 

Characterization of the melanoma miRNAome by deepsequencing (論文PDF） 

■　お知らせ
次回配信予定： 2010.05.26 

GA関連論文 
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